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厄尔尼诺现象通常会导致东南亚地区高温少雨甚至干旱，不利于油棕树的生长，从而导致棕榈油单产和产量增速放缓或者是减少。一般来说将，强厄尔尼诺现象对棕榈油的产量影响大于弱和中等强度的厄尔尼诺现象。
棕榈树作为一种多年生喜雨作物，一般要求年平均降水量在1500mm以上，若无洪涝灾害，降水量多利于油棕树生长。棕榈油在月降雨量200—350mm时，产量相对较高。棕榈油的产量具有明显的季节性规律，即从3月产量开始增长一直到10月份达到最高，然后产量开始下降。这主要和东南亚的降雨有关，棕榈油的增产周期是东南亚的传统雨季，棕榈油生长旺盛。棕榈果成熟的前5—15个月是棕榈树的花絮发芽和授粉阶段，此时降雨量将影响雌雄花发育比例，过少的降雨易于形成更多雄花，造成单产下滑。厄尔尼诺造成的东南亚地区干旱一般会影响8—10个月后的棕榈油产量，导致产量降低。
JCI统计数据显示，2000年以来中等以上强度厄尔尼诺有两次，其一是2009年7月-2010年3月份中等强度厄尔尼诺，按照对产量影响8-10月滞后计算，正好对应影响2010年全年棕榈油产量，MPOB数据显示，2010年马棕油产量1700万吨，月均产量142万吨。较非厄尔尼诺年份月均产量160万吨降幅11%。
其二是2014年10月-2016年4月的超强厄尔尼诺事件，由于2014年10月到2015年6月都属于弱厄尔尼诺时期，对产量影响并不太明显。当2015年7月开始随着厄尔尼诺强度达到超强厄尔尼诺，对马来西亚棕油产量的真正影响体现在2016年，2016年马来西亚棕油产量1732万吨，月产量均值144万吨，较非厄尔尼诺年份月均产量160万吨降幅10%。
其三，东南亚棕榈油产量周期规律标明，每年的11月至次年2月为减产周期，而从3月至10月份为棕榈油产量增加高峰期。若厄尔尼诺高峰与棕榈油产量减产周期共振，预估会放大棕油产量下降幅度。按照此轮厄尔尼诺自2023年6月开启，预估会对2024年东南亚棕榈油产量造成影响。按照前两次中等强度厄尔尼诺对马来西亚棕榈油产量下降10%计算，预估2024年马来西亚棕油产量减产幅度或在150-180万吨左右。
